Во время Русско-турецкой войны 1787—92 крепость была взята 14 (25 сентября) 1789 передовым отрядом Хосе де Рибаса русских войск под командованием генерала И. В. Гудовича (при участии черноморских казаков под командованием З. Чепеги и Антона Головатого).
После падения Очакова в декабре 1788 года турецкий флот сделал своей региональной базой гавань Хаджибея.
Захват Хаджибея становился первоочередной задачей для очищения побережья между Днестром и Днепром от турецкого флота.
Подготовка к захвату крепости началась летом с 1789 года с усиленной разведки. 3 (14) сентября 1789 года по приказу Потёмкина из Очакова к Хаджибею вышли три конных и три пеших полка казаков Черноморского войска под командованием войскового атамана З. Чепеги и войскового судьи А. Головатого при шести пушках.
Дабы скрыть манёвр, войска продвигались только ночью и 12 (23) сентября 1789 года достигли Пересыпи.
На следующей день к казакам присоединились регулярные русские войска – один батальон Троицкого пехотного полка во главе с командиром полка полковником А. С. Хвостовым и Николаевский гренадерский батальон во главе с командиром секунд-майором Воейковым при батальонных, полевых и осадных орудиях.
Из них и упомянутых шести казачьих полков составился передовой отряд под общим командованием генерала де-Рибаса.
Основные силы русской армии под командованием генерала И. В. Гудовича шли на один дневной переход позади.
На день 13 (24) сентября 1789 года весь передовой отряд расположился в овраге – Кривой балке, скрытно от неприятеля.
Посланные ранее к Хаджибею казаки донесли де Рибасу, что гарнизон крепости состоит всего из 300 человек при 12-ти пушках, но оборону усиливает турецкий флот – около 40 судов в море и 33 лансона, стоявших на якоре близ берега.
Де-Рибас принял решение начать штурм крепости, не дожидаясь подхода основных сил. На перешейке между морем и Куяльницким лиманом генерал разместил батарею из 4-х осадных и 12-ти полевых орудий (всю имеющеюся в его отряде артиллерию), направив её огонь в море – чтобы вредить неприятельскому флоту и не позволить ему помочь защитникам крепости.
В то же время были точно распределены действия отрядов при штурме крепости. Секунд-майор Воейков должен был, открыв себя неприятелю и отвлекая его внимание на себя, занять окрестности замка, отрезая возможность как высадки десанта с турецких кораблей, так и возможность бегства из крепости гарнизона.
Основная роль отводилась батальону под командованием полковника Хвостова, который при поддержке с флангов двух полков черноморских казаков должен был, двигаясь вдоль берега, подойти скрытно к крепости и штурмом овладеть крепостным валом. Расчет был и на внезапность, и на слаженность действий всех отрядов.
В 4 часа утра турки заметили приближающиеся колонны русских, но было уже слишком поздно. В считанные минуты батальон полковника Хвостова, где находился и де-Рибас, овладел крепостью.
Однако взятием крепости бой не закончился.
Утром, как только рассвело, турецкий флот подошел к берегу и попытался огнем кораблей отбить крепость.
И хотя перевес сил был на их стороне, вернуть себе Хаджибей турки не смогли.
Этому способствовал сильный ветер, затрудняющий маневрирование турецких судов, и спешно присланная Гудовичем батарея из 12-ти пушек под командованием майора Меркеля, развернутая на берегу, у подножья захваченной крепости, против турецкого флота и своим умелым огнем отогнавшая турок.
