Одной из целей правительства России была организация масштабного и легального ведения переселенческого движения. Поэтому, участники экспедиции старались определить права собственности казахов на землю и нормы их использования. С этой точки зрения, вхождение в состав специалистов Алихана Букейханова, впервые организованной в казахской степи экспедиции, было полезным для определения им научного воззрения, характеризуемого как либеральный.
А. Букейханов вел исследовательские работы в Омском, Павлодарском, Каркаралинском и Семипалатинском уездах. О его деятельности имеются сведения во 2, 4, 6 и 10 томах «МКЗ». Так, Алихан Букейханов сделал экспертизу и описал в источнике волости Кызылтау, Алтыбай Павлодарского уезда. А также, сделал таблицу родов уезда и определил с какого периода казахское население стало расселяться в этом крае. При этом, он тщательно изучив памятники устного народного творчества XVII-XIX вв., внес свой вклад в восстановление истинной истории казахов степных областей.
Известный ученый А. Букейханов, говоря о важности материалов экспедиции по урегулированию земельного вопроса, тем не менее выражал свое несогласие с итогами исследований. Дело в том, что целью царизма было паралельное развитие кочевого скотоводства и земледелия, а А.Букейханов был сторонником постепенного и добровольного перехода кочевников в оседлый образ жизни. Также он был против кризиса хозяйства казахов, не имевших навыков для работы в новых условиях, политики русификации и попытки уничтожения священных ценностей казахского народа.
Алихан Букейханов был недоволен политикой царской власти, организовавшей повторные исследования после окончания работы экспедиции Ф.Щербина. Об этом он написал в газете «Казах»: «Критикуя, несколько раз уменьшив прежние оставленные земли казахам нормой Щербина, выпустили новые нормы для кочевых казахов».
Многие статисты высоко оценивали деятельность А. Букейханова в экспедиции Ф.Щербина. Особо отмечал его заслуги в исследовании края известный статист А.А.Кауфман. Также имеются архивные материалы свидетельствующие о том, что А.Букейханов после завершения экспедиции Ф. Щербина в 1903 году, оставался в своей должности еще 2 месяца. В документе от 5 января 1905 г. являющемся официальным письмом Департамента Государственного имущества, говорится о завершении работы исследовательской экспедиции в степных областях с 1 января 1904 года. Также в письме есть сведения о том, что члены исследовательской экспедиции А. Букейханов и П. Васильев, по специальному заданию остаются в прежних должностях до неопределенного времени: «… Департамент полагает справедливымь оставить ихь на работахь на прежних условияхь, т.е. за прежнее вознагражденіе, еще на два месяца, т.е. до 1-го Марта 1904 года». Решено было поручить данным исследователям сбор еще не полностью опубликованного «МКЗ».
А. Букейханов наряду с этим исследовал структуру родо – племенного общества казахов, написал родословную, сделал глубокие и объективные заключения и обозначил на карте населенные пункты обитающих родов. Эти данные были систематизированы и опубликованы в «МКЗ». Поэтому есть основание говорить о том, что эти источники ценные и очень важные для исследования родо-племенного состава казахского общества. В отечественной историографии многие исследователи отмечают, что экспедиция Щербина, где участвовал А. Букейханов не принесла какой либо вред при рассчитывании земельных наделов для традиционного казахского кочевого и полукочевого хозяйства.
