На объединенном факультете на первом этапе начали свою работу 12 кафедр, 8 из них были сформированы в Тимирязевке и по 2 кафедры присоединились из МГАУ им. В. П. Горячкина и МГУП.
Произошло не только увеличение численности студентов и преподавателей, но и расширение масштаба научно-исследовательской и образовательной деятельности факультета за счет новых направлений и профилей подготовки: «Экономика, организация и управление инженерно-техническими системами в АПК», «Экономика и управление природопользованием». Научно-методические основы указанных направлений заложены ведущими учеными-педагогами Н. С. Власовым, Ю. А. Конкиным, Н. М. Морозовым, Д. Т. Зузиком, К. П. Арентом, В. Т. Водянниковым, В. П. Красношековым и др.
Факультет активно сотрудничал с университетами зарубежных стран, позволяя студентам обучаться, а преподавателям повышать квалификацию, получая огромный образовательный, научный и практический опыт. Среди них были Гумбольдтский университет (г. Берлин, ФРГ), Университет Хойенхам (г. Штутгарт, ФРГ), Университет Вагенинген (г. Вагенинген, Нидерланды), Словацкий аграрный университет (г. Нитра, Словакия), Чешский университет естественных наук (г. Прага, Чехия), Университет природных ресурсов и прикладных наук (г. Вена, Австрия), Варшавский университет естественных наук (г. Варшава, Польша), Институт аграрного развития стран Центральной и Восточной Европы (ИАМО) (г. Халле, ФРГ), Экономическая школа в Анжи (Франция) и др.
Основными направлениями сотрудничества стали проведение научных конференций, реализация совместных научно-исследовательских и образовательных проектов, стажировки преподавателей, обмен студентами. Для выпускников факультета учреждена ежегодная премия Роберта Уолкера (США) «Лучший выпускник года».
Выпускники факультета готовились для отраслей АПК и народного хозяйства, инженерно-технической сферы АПК, водохозяйственной деятельности и природопользования, их производственной и социальной инфраструктуры, для работы на муниципальных, региональных и федеральных уровнях управления, в организациях различных сфер и форм собственности.
В 2015 г. состоялся последний выпуск специалистов по специальности «Экономика и управление на предприятии (по отраслям)». Общая численность выпускников на факультете превысила 450 человек. Состоялся также первый выпуск бакалавров по направлению «Бизнес-информатика».
В ходе оптимизации структуры (2014—2016 гг.) с 1 сентября 2016 г. в составе факультета был сокращен до семи кафедр: политической экономии; экономики; организации производства; экономической кибернетики; управления; мировой экономики; маркетинга. В том же году по инициативе факультета решением Ученого совета Университета была создана первая в Тимирязевке базовая кафедра на базе агрохолдинга ГК «АгроПромкомплектация» с названием «Кафедра инновационно-инвестиционного агробизнеса».
Обеспечиваемый факультетом высококачественный образовательный процесс в сочетании с научными исследованиями и практикой в передовых организациях, компаниях и зарубежных вузах являлись гарантией высокой конкурентоспособности выпускников на рынке труда.
Важным событием для факультета стало решение Ученого совета Университета от 23 января 2017 г. о присвоении факультету имени А. В. Чаянова.
