Мерказин осуществлял обязанности коменданта Яблонецкой волости с 20 июня до середины июля 1919 г. Впоследствии был отправлен в Нарву, где получил назначение в этапно-хозяйственный отдел в Гдов на должность заведующего заготовками.
При отступлении Северо-Западной армии Мерказин вместе с семьёй выехал в Эстонию. В конце 1919 г. из Нарвы вместе с госпиталями направлен вглубь Эстонии. В результате обосновался в г. Печоры. С начала 1920 по 1937 г. занимался частным извозом на собственной лошади в городе Печоры (Петсери).
Константин Мерказин проживал с супругой Ниной Николаевной, её матерью Анной Ивановной Глазуновой (ок. 1853 – после 1940) и своей матерью Александрой Сергеевной (? —1932).
С 1927 г. Мерказин состоял в рядах благотворительного общества «Союз русских увечных воинов», занимавшегося сбором средств на поддержку инвалидов войны. До 1937 г. Мерказин – уполномоченный от Тартуского отдела этой организации по Печорскому краю, с 1937 г. состоял в Таллинском отделе.
С 1927 г. Мерказин являлся сотрудником генерала А. К. Баиова и барона А. Ф. Штакельберга по доставке в Печоры и распространению контрреволюционной литературы «Братства русской правды» (БРП) среди русского населения Эстонии. Являлся активным деятелем БРП, руководителем БРП в Печорском уезде. Группу БРП в количестве пяти человек в Печорах Мерказин организовал в 1928 г.
«Братство русской правды» – контрреволюционная монархическая организация, созданная для борьбы против коммунистов и советской власти, вся практическая деятельность которой была направлен на подрыв строя в Советском Союзе и восстановление монархии в России. Данная организация была официально запрещена в Эстонии.
Основным направлением работы группы БРП была транспортировка «братской» литературы (к таковой можно отнести «Бюллетень Центра Братства Русской Правды в Северо-Американских соединённых штатах», журнал «Русская Правда» и иные антисоветские издания) через своих людей среди рыбаков в Чудском озере. По словам Мерказина, он вкладывал пачку листовок БРП в бутылки и отправлял их в плавание по Псковскому озеру к советскому берегу при помощи попутного ветра, также он забрасывал листовки в железнодорожные вагоны на станциях Печоры и Изборск.
Группы, возглавляемые К. Д. Мерказиным и В. Ф. Каринским, при поддержке сотрудников спецподразделений Эстонии сумели наладить окно через границу в районе д. Иверицы. Через окно неоднократно на территорию СССР ходили диверсионные группы Ильина, Осокина, Борисова, Малахова, оставаясь в Советской России по нескольку месяцев. Информация, добываемая на территории СССР передавалась спецслужбам Эстонии.
Вероятно, Мерказин имел отношение к Российскому общевоинскому союзу (РОВС), хотя на допросах отрицал данную связь.
В 1937 г. Константин Мерказин с семьёй переехал на жительство в Таллин и до 1938 г. работал в столярно-слесарной и никелировочной мастерской, до 1939 г. работал мастером по паркету, а после сторожем на заводе Круль.
После присоединения Эстонии к СССР Константин Мерказин был арестован 28 сентября 1940 г. сотрудниками НКВД ЭССР по обвинению в сотрудничестве с разведывательными органами иностранных государств и переброске иностранных разведчиков на территорию СССР с контрреволюционными и шпионскими заданиями.
Этапирован в Ленинград и с 6 ноября 1940 г. содержался во внутренней тюрьме управления госбезопасности в Ленинграде.
