Иеромонах Варнава (Клыков) начинал свою деятельность в Калужской губернии, город Козельск, Свято-Введенская Козельская Оптина Пустынь, монахом. Должность послушник до 1924 года. Был келейником оптинского старца Анатолия (Потапова). Там подружился с любимым послушником старца Анатолия Владимиром Сергеевичем Веревкиным, (в будущем – игуменом Варсонофием). Пострижен в монашество с именем Варнава (по данным пострижен в мантию в 1926 году). В 1924 году, когда Оптина пустынь была уже закрыта, переехал в Стрельну, в Троице-Сергиеву пустынь, Санкт-Петербургской губернии, Петергофский уезд, поселок Стрельна, Стрельнинская Сергиево-Троицкая пустынь, монах, иеромонах. Год начала 1924. Возведен в сан иеромонаха. Потом Троице-Сергиева Пустынь была закрыта, и он остался проживать около нее, в Санкт-Петербургской губернии, Петергофского уезда, поселок Старый Петергоф, Тихвинская кладбищенская церковь иеромонах до 4 октября 1932 года.
С конца 1920-х годов о. Варнава стал часто приезжать для совершения богослужений в Старый Петергоф, в тайную монашескую женскую общину сестер, связанную с Александро-Невским братством и организованную на подворье Серафимо-Дивеевского монастыря в 1922 году по благословению Митрополита Вениамина архимандритом Гурием (Егоровым).
Руководителем общины с мая 1922 года по февраль 1932 года был иеромонах (а с 1930 года игумен) Варсонофий (Веревкин). С 1930 года у о. Варсонофия начала проявляться болезнь паркинсона. Чтобы совершить проскомидию, ему, в конце 1931 года, даже при небольшом чтении записок о здравии и о упокоении, требовалось около часа. В лице его друга иеромонаха Варнавы Господь даровал болящему о. Варсонофию дивного помощника. Сестры познакомились с о. Варнавой, очень его полюбили. По воспоминаниям, он был хроменький (ходил на протезе), и они, увидев его приближавшимся к их дому, всегда выбегали навстречу. Он ласково приветствовал их: «Детки мои». Запомнились и такие его слова: «Трудитесь, молитесь, не расходитесь».
И о. Варсонофию, и о. Варнаве было открыто, что всем им выпадет пострадать за Христа. И они заранее готовили о. Нектария и сестер к исповедническому пути. У них были готовы маленькие узелочки на случай их ареста. В конце 1931 года сестра Нина Яковлева прямо спросила о. Варнаву, когда их арестуют. Он ответил, что произойдет это после ее именин, т.е. после 27 января 1932 года. Так оно и случилось. Всех их арестовали в одну ночь – 18 февраля 1932 года, в день памяти святителя Феодосия и иконы Божией Матери «Взыскание погибших).
О. Варнава был арестован позже. Проживал Ленинградская область (Санкт-Петербург, Петродворцовый район), поселок Стрельна, улица Трудовой Коммуны, дом 51, до 4 октября 1932 года, когда был арестован. Осужден Выездной Сессией Коллегии ОГПУ 10 декабря 1932 года. Обвинение «антисоветская деятельность». Статья ст.58—10,58—11 УК РСФСР. Приговор 3 года концлагерей с заменой на высылку в Северный край на тот же срок. Из показаний о. Варнавы на допросе: «Всякую власть почитаю, так как она от Бога, но царская власть все же лучше советской, так как она не преследует духовенство. Если бы сейчас была царская власть, то ее, безусловно, вышел бы встречать с крестным ходом. Я никогда ничего против советской власти не имел и не говорил… Виновным себя не признаю, агитации против советской власти не вел, никакого преступления не совершил, и мне сейчас приходится страдать за веру Христову… Вся моя жизнь прошла в служении Богу, и до конца дней своих я буду молить Его, чтобы простил грехи людей, которые не знают, что творят
