И уже 1 ноября 1996 года господин Нефедов отправил факс от своего имени профессору Бонтэ с предложениями о сотрудничестве в сфере идентификации личности человека.
Тот в свою очередь, получив данный факс, сердечно поблагодарил господина Нефедова. Он ответил ему, что, само собой разумеется, что он готов к любой кооперации.
В своем сообщении он указал на то, что он уже высказался о путях дальнейшего продвижения в исследованиях по этой теме в письме к Олегу. Идею о привлечении к данной работе живущих за границей членов семьи Романовых он считал естественной и очень хорошей и также предполагал, что данной проблеме, которую собирался решать фонд, необходимо было дать оценку. Он повторил свое предложение о желании заново исследовать пробы, взятые из скелетов, найденных под Екатеринбургом. Он разъяснял, что между тем технология по ДНК-экспертизам скачкообразно усовершенствовались, и что они могли бы исследовать значительно больше систем. Он просил информировать его о разработке конкретных предложений.
События между тем развивались своим чередом.
27 ноября 1996 года Ковалев А. В. сообщал Вольфгангу Бонтэ, что он очень рад, что их сотрудничество может получить дальнейшее продолжение. На настоящий момент группой экспертов из Санкт-Петербурга и Хельсинки проведен ряд стоматологических и рентгеноцефалометрических исследований останков из Екатеринбурга, Великого Князя Георгия Александровича Романова и ныне проживающей в Санкт-Петербурге и Германии семьи Филатовых.
Рядом исследователей из Санкт-Петербурга проведены сравнительные исследования почерка и фотоснимков Цесаревича Алексея и Василия Филатова. Без всякого сомнения, решение поставленной задачи об идентичности личности Алексея Романова и Василия Филатова требует проведения комплексного исследования черепов, их рентгенограмм, томограмм, ДНК, фотоснимков, почерка и исторических (в том числе, и медицинских) документов.
К сожалению, подчеркивал Ковалев А. В., их исследования на тот момент носили разрозненный характер, что связано с целым рядом независящих от них факторов, и это привело к тому, что они не могут сейчас ни достоверно подтвердить, ни отвергнуть идентичность.
У Ковалева А. В. не вызывало сомнения, что окончательное решение данного вопроса имело бы не только большое нравственное значение, но и позволило бы разработать методологические подходы к решению вопросов идентификации личности погибших, в случаях поступления на исследование останков нескольких тел.
Он отмечал, что недостаточная разработка на тот день данного вопроса вызвала большие затруднения, как при проведении исследований останков из Екатеринбурга, так и при проведении им, и его коллегами, исследований погибших в Чечне. На его взгляд, тогда имелась реальная возможность продолжения доктором Бонтэ исследований ДНК в материале из волос и ногтевых пластин, и исследований с помощью разработанных методик в Санкт-Петербурге с использованием сравнительного анализа рентгенограмм черепа, позвоночника, почерка и фотопортретов.
Андрей Валентинович Ковалёв считал, что после того, как закончится проводимый этап, необходимо было бы провести обсуждение полученных результатов и плана проведения дальнейших исследований.
15 декабря 1996 кандидат медицинских наук Ковалев А. В. сделал очередное предложение немецкой стороне касательно семьи Романовых. Он хотел направить для проведения исследований, изъятые в июле 1994 года, в процессе исследования тела Великого Князя Георгия Александровича Романова, образцы биологических объектов (пряди волос с головы и ногтевую пластину пальца стопы).
