Именно в Мистре созидал свою философскую теорию, выходец из Константинополя, Георгий Гемист (135/1360 – 25.06.1352), более известный под псевдонимом Плифон.
Пользуясь безусловным покровительством Палеологов, отказавшихся от духовно-религиозного господства при дворе и развивавших светское начало, Плифон добился утверждения своей философской концепции.
Поклонник античного философа Платона, Плифон стремился возродить на обломках Византии античный эллинизм и прежде всего в религиозной сфере. Конструируя новую универсальную систему религиозных взглядов, Плифон пришёл к отрицанию традиционных религий, христианства и ислама, основанных на единобожии. Призывал к поклонению греко-римским божествам, возрождая широкий пантеон древнегреческих языческих богов.
Отстаивая интересы светских землевладельцев, философ особенно резко относился к монахам. Прежде всего, он осуждал церковно-монастырское землевладение, отказывая в праве духовенству пользоваться какой-либо долей государственного богатства. По выражению философа, монахи, будучи освобождены от всяких общественных обязанностей перед государством и обществом, ведут жизнь бездельников и трутней и поэтому не имеют право пользоваться государственным имуществом. Плифон указывал, что раздача средств духовенству и монастырям приносят большой вред укреплению безопасности государства.
Кроме теоретических изысканий Плифон разработал проекты широких политических реформ, направленных на централизацию управления и ликвидацию церковного землевладения, призванных вывести Грецию из кризиса византийской государственности и вернуть её к исконным, античным началам.
Трезво оценивая возможности клонившейся к упадку Византии в борьбе с турками Плифон, проведший несколько лет в османском плену, отрицая национально-патриотическое начало, был приверженцем союза с латинянами. Осознавая, что помощи от Запада можно достичь, лишь пойдя на значительные уступки, философ выступал за церковную унию. Отрицая само христианское начало, Плифон считал унию лишь простой политической сделкой. Именно Плифон был главным советником императора Иоанна VIII Палеолога (1425 – 1448) в деле о церковной унии. Философ сопровождал императора во время поездки в Италию и участвовал в работе Ферраро-Флорентийского собора, утвердившего церковную унию.
В Италии Плифон приобрёл много сторонников среди итальянских гуманистов, активно изучавших античную философию и науку. По просьбе многих просвещённых мужей Плифон написал философский трактат с разъяснением идей Платона, набиравших популярность среди итальянских гуманистов. Его популярность в Италии была очень велика. В самой же Византии к идеям Плифона относились более сдержанно, хотя находились и приверженцы.
Именно Мистра стала главным опорным пунктом византийцев, проводивших постоянное наступление на франков, стремившихся отвоевать Пелопоннес и всю Грецию у латинян. Этот процесс получил в исторической науке название «греческой реконкисты».
Вся политическая история византийской Мореи была связана с непрерывными войнами с франками. Поэтому связь византийского анклава на юге Греции со столицей была жизненно необходима, поскольку морейцы постоянно нуждались в военной и материальной помощи.
Положение Мореи, окружённой враждебными франкскими барониями, ещё более осложнялось её отдалённостью от Константинополя. Связь со столицей была не постоянной. Сухопутный путь был невозможен. Единственно доступный морской путь, в условиях растущей турецкой экспансии, становился всё более затруднительным. Решения императора достигали Мистры с большим опозданием, а порой обстановка требовала немедленного принятия решений. Система управления областью, основанная на часто сменяемых наместниках была недейственной, так как императорские ставленники не были в состоянии по-настоящему ознакомиться с местными условиями и положением дел. Поэтому для лучшего управления Мореей императором Андроником II в 1308 году было установлена особая деспотия. Деспотов назначал сам император. Их власть была пожизненной. Сначала титул деспотов Мореи закрепили за собой представители византийского аристократического рода Кантакузенов, но в 1383 году власть перешла к Палеологам.
