Иоанн XII предпринимал безуспешные попытки вернуть себе престол, пока не погиб.
X и XI вв. были временем процветания варварства в Вечном городе. Доказательством тому может служить история перехода папского престола от одной воинствующей группировки к другой. В 1012 г. Феофилакт, сын графа Тускуланского, самовольно захватил нынешний Ватикан и провозгласил себя папой под именем Бенедикт VIII (1012—1024). Он стал первым узурпатором ватиканского престола. Папа сделал правителем Рима своего брата Романа, и Вечный город перешел, таким образом, во владение Тускуланского дома.
Новые властители оказались дальновидными политиками и сумели удержать власть в своих руках. Папа стал препятствовать торговле церковными должностями и запретил духовенству жениться. Но эти нововведения были проигнорированы.
После смерти Бенедикта VIII Тускуланский дом проявил расторопность и, чтобы не выпустить власть из своих рук, купил место папы римского для двенадцатилетнего (по другим сведениям пятнадцатилетнего) графа Теофилакта Тусколо, восшедшего на престол под именем Бенедикта IX (1032—1044, 1045, 1047—1048).
Как только Бенедикт подрос, он вздумал полностью насладиться жизнью и стал развлекаться и грабить по ночам римских жителей. Как известно, в прошлом многие папы были закоренелыми грешниками, но Бенедикт затмил всех. В конце концов, всем надоели его бесчинства. Чувствуя шаткость своего положения, папа решил в 1044 г. избавиться от своего сана и продал его за 650 кг золота римскому богатому еврею-выкресту Иоанну Грациану, который был в то время протопресвитером церкви Святого Иоанна у Латинских ворот. Так на престоле воцарился новый папа – Григорий VI (1045—1046). Правда, весной 1045 г. Бенедикт IX сделал попытку вернуть себе папскую тиару, но не продержался в Риме и трех месяцев – был изгнан горожанами.
Папство тогда находилось в крайнем упадке. Казна была пуста, а священники часто не отличались благопристойностью нравов. При помощи своего капеллана Гильдебранда Григорий VI попытался навести порядок в римской церкви. Однако некоторые римские фракции не захотели подчиняться папе и обратились к германскому королю, чтобы тот разрешил спорную ситуацию. В 1046 г. Генрих III (годы правления 1046—1056) созвал в Сутри около Рима церковный собор. Бенедикт IX отказался явиться на него, был осужден, низложен и приговорен к заключению в монастырь. Григорий VI был обвинен в покупке папского титула – симонии. Он сам не отрицал данного факта, но просил учесть обстоятельства, при которых это произошло. Тем не менее епископы убедили Григория добровольно отречься от престола. В 1047 г. Григорий VI направился в Кёльн, где и отказался от папского трона. Его секретарем и товарищем в этом путешествии был молодой монах Гильдебранд, который тридцатью годами позднее прославился как Григорий VII – великий папа-реформатор. На место низложенных пап синод избрал бамбергского епископа Суидгера, одного из самых влиятельных германских иерархов. Он стал папой Климентом II (1046—1047).
Через несколько дней после восшествия на престол этот папа возложил императорскую корону на германского короля Генриха III. Таким образом, город в очередной раз перешел под опеку германцев, утратив связь с Тускуланским домом. Понтификат Климента II официально положил начало эпохе цезарепапизма, когда церковное управление было полностью подчинено германским светским владыкам.
