В связи с переносом государственной границы на запад болотистый район реки Припять целиком оказался на территории СССР, ещё больше разделив театр военных действий на два разобщенных стратегических направления, что затрудняло маневр силами и средствами вдоль фронта. По этому поводу в политическом и военном руководстве страны существовали различные точки зрения. В начале августа 1940 г. наркому Тимошенко был доложен новый оперативный план, в основу которого были положены оперативные расчеты, выполненные маршалом Б.М. Шапошниковым. Общий замысел действий базировался на предположении, что главный удар немцы могут нанести севернее Припятских болот. Но это в корне противоречило взглядам Сталина, который после столь удачного присоединения утраченных территорий бывшей Российской империи, обладал непререкаемым авторитетом в военных и международных делах. Вождь, вопреки Генштабу, считал, что немцы обязательно захотят овладеть хлебом, углем и рудой Украины, необходимыми им для ведения длительной войны. Следовательно, именно это стратегическое направление и необходимо усиливать.
19 августа Б.М. Шапошников был заменен генералом армии К.А. Мерецковым. Под его руководством оперативный план был кардинально переработан, получив название «Соображения об основах стратегического развертывания вооружённых сил Советского Союза на Западе и на Востоке на 1940 и 1941 годы». В нем был сделан вывод о необходимости быть готовым к войне на два фронта: на Западе и Востоке. Генеральный штаб, несмотря на заключенные с Гитлером соглашения, определил основного противника СССР в Европе – Германию – и возможный состав враждебной коалиции, в состав которой включил Финляндию и Румынию, лелеющие надежду в союзе с ней вернуть утраченные ими в 1940 г. территории. На Западном ТВД предусматривалось развернуть войска трех фронтов: Северо-Западного (СЗФ), Западного (ЗапФ) и Юго-Западного (ЮЗФ). На случай войны с Японией планировалось создать Забайкальский и Дальневосточный фронты.
План предлагал два варианта стратегического развертывания на Западе. Согласно первому из них, главные силы Красной армии должны были действовать южнее Припятских болот, имея главную задачу разгромить люблин-сандомирскую группировку немцев и отрезать Германию от Балкан, и прежде всего, от румынской нефти. Именно этот вариант считался основным. По второму варианту решающие сражения намечались севернее Брест-Литовска, где задачей советских войск ставилось: нанести поражение главным силам германской армии в пределах Восточной Пруссии и овладеть последней. В объяснительной записке к плану указывалось, что окончательное решение на развертывание будет зависеть от той политической обстановки, которая сложится к началу войны. Считалось, что разведка сумеет своевременно определить, где будут развертываться главные силы вражеской коалиции, и советское командование сможет скорректировать план развертывания своих главных сил. На этом основании оба варианта развертывания Красной армии или к югу, или к северу от Бреста фактически рассматривались, как равнозначные. При этом в обоих случаях предполагалось, что боевые действия начнутся с активной обороны с задачей прикрытия мобилизации и сосредоточения главных сил советских войск.
Решение разрабатывать оба варианта развертывания главных сил можно признать оправданным только с точки зрения их предварительной проработки. На практике же, учитывая слабо развитую транспортную систему страны, в том числе и недостаточную пропускную способность железных дорог, необходимо было заранее, ещё в мирное время решить, где сосредоточивать основные усилия – севернее или южнее Полесья. Продолжать сидеть сразу на двух стульях, имея перед собой куда более грозного противника, нежели Польша, было, по меньшей мере, опасно.
