Эмир Хайдар воевал с Кокандом из-за Ура-Тюбе, бывшего в вассальной зависимости от Бухары, а также защищал от них бухарские города Джизак, Пешагир, Заамин и Урмитан.
На юг и запад Бухарского эмирата в 1804 г. наступал хивинский хан Ильтузер. Но бухарцы разбили хивинские войска на берегу Амударьи.
Распри начались среди родственников бухарского эмира. В Мерве отложился брат эмира Дин-Насыр-бек. Эмир Хайдар приказал разрушить Султанбендскую плотину, что привело к засухе и гибели посевов. Дин-Насыр-бек бежал в 1804 г. в Мешхед вместе с 1000 мервских семей. Эмир Хайдар переселил часть мервцев в долину Зеравшана, а в Мерв – 200 семей туркмен[76].
На севере Бухарского эмирата кокандцами был захвачен Ташкент. Кокандский хан Омар начал наступление на г. Туркестан и захватил его. Это вызвало ответные набеги бухарцев на кокандские города. Хивинцы систематически совершали набеги на север и северо-восток Бухарского эмирата. Они объединили силы с китай-кипчаками, каракалпаками, кенегесами Шахрисябза, кокандцами, пытаясь захватить Самарканд. Но это им не удалось сделать.
Правление в Бухарском эмирате Насруллы-хана (1826–1860) было направлено на укрепление и централизацию государства. Полунезависимыми владениями оставались Шахрисябз и Китаб, которые удалось покорить лишь в 1856 г.
Одновременно бухарский эмир стремился увеличить свои владения за счет Хивинского и Кокандского ханств.
В 1826 г. начались волнения в Мерве туркмен-сарыков – подданных Хивы. Они обратились за помощью к бухарскому эмиру, их поддержали другие туркменские племена. Хивинский хан Аллакуль жестоко расправился с жителями восставших туркменских аулов.
В 1842 г. хивинский хан Аллакуль напал на бухарский Чарджуй. В это время бухарский эмир Насрулла начал осаду столицы Коканда. Казахи вторглись во владения кокандцев.
Эмир Насрулла, в правление хивинского хана Рахимкула, в 1843 г., напал на крепость Хазарасп. Но эмир Насрулла был разбит хивинским войском и отступил в Бухару. В этот момент к нему явились туркмены и заявили о своей готовности подчиниться ему. Эмир Насрулла отправил в туркменский Мерв бухарского наместника[77].
Начавшаяся в Фергане в XVIII в борьба за преодоление феодальной раздробленности продолжалось в XIX в. Алим-хану (1800–1809) удалось объединить Фергану, Ташкент и Чимкент.
В 1815 г. кокандский Омар-хан захватил город Туркестан, подчинявшийся Бухарскому эмирату. Это привело к переходу под власть Коканда юга Казахстана до устья Сырдарьи. На месте пересечения торговых путей из Ташкента, Бухары и Хивы на Оренбург кокандцы построили крепость Ак-Мечеть. В 1812 г. Омар-хан отправил кокандское посольство в Россию. В 1813 г. Коканд посетил российский посол Ф. Назаров.
В 1821 г. казахи Старшего жуза восстали против кокандцев и вернули казахские города Чимкент и Сайрам.
В 1829 г. кокандский хан Мухаммед-Али (1822–1842) совершил военный поход на Кашгар, где восстало мусульманское население против Китая. С приближением значительных китайских сил, Мухаммед-Али покинул Кашгар. С ним ушли в Фергану 70 тыс. кашгарских мусульман, большая их часть была поселена в окрестностях и городе Шахрихане. Когда наладились кокандско-китайские отношения, часть кашгарцев вернулась в Кашгар[78].
Кокандцам удалось подчинить себе таджиков Каратегина, живших в горах на юге Алайского хребта. Таджики Дарваза, Шугнана, Вахана и Рошана номинально подчинялись Кокандскому ханству.
