Одной из первых задач Примо де Риверы было завершение разорительной войны в Марокко. Посетив Северную Африку (Франко снова был в Сеуте в ранге командира иностранного легиона), новый диктатор (а Примо де Ривера получил, практически, ничем не ограниченную власть) объявил, что намерен сдать все марокканские владения Испании. В военном лагере под Бен Тиебом в июле 1924 года между Франко и Примо де Риверой разгорелась ожесточённая дискуссия. Франко и мысли не мог допустить о выводе войск – это означало, что все жертвы многолетней войны были напрасными. Но всё же Примо де Ривера добился главного – заверений Франко в том, что его легион не восстанет, если испанцы оставят плохо защищённые высоты Рифа, оставив за собой старые надёжные укрепления.
Эти переговоры закончились тем, что Франко остался командовать легионом, получив от Примо де Риверы звание полковника. Диктатор покинул Марокко, а полковник Франко приступил к осуществлению предложенного им и одобренного Примо де Риверой плана – закрепиться на длинном участке от Мелильи к Тетуану, Сеуте и Эль-Араишу при помощи высадки сухопутного десанта. После захвата плацдарма на территорию Марокко должны были высадиться французские войска под командованием маршала Петена, воплотив в жизнь идею правительства Франции взять под контроль территорию Марокко совместно с Испанией.
Операция была проведена блестяще. В начале 1925 года легионеры Франко высадились в бухте Эль-Хосейма и несколько дней удерживали позиции, пока французские транспортные суда пережидали шторм. Когда берберам уже казалось, что испанцы разбиты, шторм улёгся, в бухту вошли французские транспорты и на сушу высадились 15 тысяч французских солдат. Берберы были разбиты, а оккупированная ими территория перешла под контроль объединённых испано-французских сил…
В Мадриде на Франко обрушился целый поток почестей и наград. Из рук короля он получил второй испанский военный орден, а из рук посла Франции – орден Почётного легиона. Следом за этим Франсиско Франко получил звание генерала, став самым молодым генералом в истории Испании и самым молодым действующим генералом в Европе. В 1926 году Франко был назначен главнокомандующим пехотной бригады в Мадриде.
В 1927 году испано-марокканская война была закончена. Её итоги нельзя назвать ни положительными, ни отрицательными – Испания оставила за собой небольшой анклав в области Гибралтарского пролива, отгороженный от остальной территории Марокко горной грядой. Но контроль над большей частью территории Марокко был утерян.
Окончание войны было ознаменовано визитом королевской четы в места дислокации испанских войск. Короля и королеву в этой поездке сопровождал молодой генерал Франсиско Франко.
А в 1928 году генерал Франко был назначен директором только что созданной военной Академии в Сарагосе. Когда он узнал об этом назначении, то обратился к Мигелю Примо де Ривере с просьбой доверить этот пост своему другу Мильяну Астраи, который после получения инвалидности оказался не у дел. В пользу кандидатуры Астари говорило и то, что тот до военной службы работал учителем и был, таким образом, профессиональным педагогом. Но Ривера был непреклонен – он хотел видеть во главе главного военного института Испании только Франко и никого другого. В конце концов, Франсиско был вынужден подчиниться.
